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自主创新是中国从“制造业大国”走向“制造业强国”的唯一路径，这一观点已被越来越多的人认同。
2006 年2 月《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006━2020 年)》的颁布和实施，预示着中国自主创新体系应运而生，并将以政府的强大力量全面推动以企业为主体的自主创新革命。
最近，科技部、国资委和中华全国总工会三部门联合开展的创新型企业试点工作进入实质推进阶段，第一批选择103家试点企业，其中既涉及高新技术产业，也涉及传统产业。
“十一五”期间，自主创新已经成为一大重要发展主题，这意味着将给股市带来新的投资主题。海通证券认为，自主创新体系将成就创新中国，中国企业将因自主创新而产生新的成长溢价。资本市场中自主创新带来的投资机会将从制造业扩展到服务业，从高科技行业延伸到传统行业。
市场人士认为，从目前发展态势看，未来3-5年时间内，我国自主创新试点企业将扩大到500家，而通过试点工作，势必带动一大批企业在竞争中增强技术创新能力，加快以企业为主体的技术创新体系建设，相关企业市场竞争力和盈利潜力也将获得大幅提高，所以，未来自主创新题材潜力无限。
从短期来看，自主创新政策落实的可见实效是提高高新技术类上市公司的会计利润；从中长期来看，将会有效激活上市公司自主研发和科技产业化的内在动力，引导上市公司树立以技术实力打造公司核心竞争力的经营思想。
在自主创新潮流下，分析师建议重点关注具有研究实力背景的上市公司；重点关注技术起步较高的行业，如生物医药行业；重点关注自主创新实力最强的行业，如输配电行业和自主创新潜力最大的行业，如中药行业等。
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